แม้ว่าอาจจะดูคล้ายกัน แต่ตู้ดูดควันและตู้ความปลอดภัยทางชีวภาพในห้องปฏิบัติการได้รับการออกแบบและทำงานแตกต่างออกไปอย่างมาก และต้องใช้อย่างเหมาะสมเพื่อให้การปกป้องผู้ใช้ มีการควบคุมเพิ่มเติมเฉพาะด้านอันตรายหรือที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการอีกมากมาย
ตู้ดูดควันสารเคมีในห้องปฏิบัติการนี้เป็นระบบระบายอากาศเฉพาะจุดที่ใช้กันทั่วไปในห้องปฏิบัติการ และเป็นวิธีการหลักที่ใช้ในการควบคุมการสัมผัสสารอันตรายเมื่อสูดดม เมื่อใช้อย่างเหมาะสม ตู้ดูดควันจะให้การปกป้องผู้ใช้ในระดับหนึ่ง