การจัดระเบียบการไหลของอากาศที่สมเหตุสมผลยังมีบทบาทที่จําเป็นในการควบคุมอนุภาค โดยการออกแบบอย่างละเอียดตําแหน่ง รูปทรง และปริมาณอากาศของช่องออกอากาศและช่องกลับอากาศรูปแบบการไหลของอากาศเฉพาะเจาะจงสามารถสร้างขึ้นภายในห้องสะอาดรูปแบบการจัดระบบการไหลของอากาศทั่วไปประกอบด้วยการไหลแบบมหาทิศทางเดียว (การไหลแบบลามินาร์) และการไหลแบบไม่มหาทิศทางเดียว (การไหลแบบกระแสอากาศ) การไหลแบบมหาทิศทางเดียวเคลื่อนไหวอย่างเท่าเทียมกันและมั่นคงในเส้นกระแสคู่เคียงซึ่งสามารถนําอนุภาคออกจากพื้นที่ที่สะอาดได้อย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพมันเหมาะสําหรับพื้นที่ที่มีความต้องการความสะอาดที่สูงมาก เช่น ห้องปฏิบัติการกระบวนการลิทอเกรฟีในการผลิตชิป Non-unidirectional flow makes use of the clean air sent out from the supply air outlets to fully mix with the air in the workshop and reduces the particle concentration through multiple cycles of dilution. มันถูกใช้อย่างแพร่หลายในห้างสรรพการที่มีความต้องการความสะอาดทั่วไปสิ่งอํานวยความสะดวก เช่น ผ้าม่านอากาศและอาบน้ําอากาศ สามารถจัดตั้ง "อุปกรณ์ป้องกันอากาศ" ณ ทางเข้าของโรงงาน, ป้องกันการเข้าของอากาศและอนุภาคที่เป็นมลพิษจากภายนอกพวกเขายังสามารถกําจัดอนุภาคที่ติดอยู่บนพื้นผิวของบุคลากรและวัสดุได้อย่างมีประสิทธิภาพ เมื่อพวกเขาเข้าหรือออก.